Στον Ε65 θα λειτουργούν 3 μετωπικοί σταθμοί διοδίων (+ ένας όταν δοθεί στην κυκλοφορία το βόρειο τμήμα).
Πρόκειται για τους σταθμούς:
- Λιανοκλαδίου στο 17,1 χλμ. με κόστος διέλευσης για τα ΙΧ στα 1,85 ευρώ
- Σοφάδων στο 66,2 χλμ. με κόστος 3,40 ευρώ και
- Τρικάλων στο 105,7 χλμ με κόστος 2,95 ευρώ.
Το σύνολο δηλαδή για έναν οδηγό που θα εισέλθει στην αρχή του Ε65 και θέλει να φθάσει έως την Καλαμπάκα είναι 8,2 ευρώ.
Ο τέταρτος μετωπικός σταθμός διοδίων που θα λειτουργήσει μελλοντικά με την ολοκλήρωση του Ε65 είναι στην Οξύνεια στο 151,9 χλμ.
Σε λειτουργία είναι επίσης οι πλευρικοί σταθμοί Ανάβρας (2 ευρώ), Προαστίου (1,15 ευρώ), Τρικάλων (0,80 ευρώ) και Καλαμπάκας (0,90 ευρώ).
Όταν ολοκληρωθεί ο Ε65 η διαδρομή από την Λαμία έως την Εγνατία θα διαρκεί 1 ώρα και 45 λεπτά, από 3 ώρες και 15 λεπτά που χρειάζονταν πριν την κατασκευή του αυτοκινητόδρομου.
